我们确定了对低的存在或两

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者的组合以下称为有反应的差异表达基因补充文本；扩展数据图;补充表。层次聚类图补充表揭示了在中比在或中更强烈激活的基因组和。这些簇包含大部分由调控的核心标记图。它们还富集了独立实验中确定的直接靶标图补充表启动子结合基序扩展数据图以及参与与相关的生物过程的基因图和补充表。令人惊讶地有助于植物免疫的转录调节。十二个星团中的五个图；和富含与植物免疫系统输出相关的基因


其中四个茉莉酸和或水杨酸途径标记物的比例过高图和;补充表这四个中的三个针对直接目标进行了富集图。和是免疫的植物激素调节剂并且至少调节拟南芥根微生物组组成。包含图片插图等的外部文件。对象名称为图介导和植物免疫系统WhatsApp 数据库输出的相互作用实验中差异表达的个基因的层次聚类。植物在含有蔗糖并补充有的培养基上发芽天然后转移到单独的µ或µ培养基不含蔗糖或与的合成群落一起再培养天。板垂直。右侧的列表示核心标记“核心”泳道或具有结合峰“”泳道的基因。每个簇的标记基因的比例。每个簇中直接靶基因的比例。和中的红线表示整个拟南芥基因组中包含分析特征的基因的比例。





星号表示显着富集或消耗≤；超几何检验。十二个簇中每个簇的基因本体富集分析摘要。富集显着性显示为。白色意味着没有浓缩。完整结果见补充表。实验中结合的基因组富含和或上调的基因。红色节点是核心标记基因。结合并在我们的实验中差异表达的基因示例。标记基因上和响应基因中在野生型植物中表达较多而响应基因下在和中表现出更高的转录水平。热图显示了和的个生物重复的平均测量值以及的个生物重复的平均测量值。与和相关的颜色键蓝色到红色将基因表达表示为分数。为了